O atual município de Vargem foi criado em 30 de novembro de 1929 e pertencia ao atual município de Bragança Paulista, que, no início, era o antigo povoado de Nossa Senhora da Conceição do Jaguari.
Seus habitantes eram bandeirantes em busca de ouro, pedras e índios para escravizar, e, ainda, agricultores, que buscavam o valor econômico da terra para estabelecer um comércio entre o sertão e o litoral.
Em 1884, houve a instalação da São Paulo Railway, companhia de estrada de ferro da região Bragantina. A estação de Vargem era a última estação do sistema. A ferrovia foi um grande fator de integração social, pois o maior movimento era de carga para a região sul de Minas Gerais.
Aniversário da Cidade: 20 de novembro
Principais Pontos Turísticos:
• Pico do Lopo
• Represa Jaguari
• Igreja Matriz
• Gruta de Nossa Senhora de Fátima
• Casarões da época do café